柯文哲翻4月21日公文回擊中央 林亮君提4質疑：哪家醫院疫苗過多？
臺北市好心肝診所8日爆出違規施打新冠疫苗爭議，中央流行疫情指揮中心9日晚間表示，尚未許可基層診所提供新冠疫苗接種服務；而臺北市長柯文哲則於10日翻出4月21日公文，回擊「北市府的作爲是有所本。」不過，臺北市議員林亮君針對此份公文，提出4點質疑，認爲柯文哲留下更多疑問，「是真的有心想要說明白嗎？」
關於公文爭議，起於指揮中心9日晚間對外表示，好心肝診所的醫護人員多已至院外接種新冠疫苗，而指揮中心也尚未許可基層診所提供新冠疫苗接種服務，臺北市政府竟無視相關規定，任意將多達1000多劑疫苗撥給該診所，既違反規定，也不合情理。
事隔一日，柯文哲10日上午臨時召開記者會表示，目前北市有6家診所，總計獲配202瓶疫苗，包括好心肝診所於6月7日獲配15瓶、並於8日再獲配100瓶。和衆診所則於6月8日獲配2瓶。此外擁有大安、民權、士林、懷寧四個分所的小禾馨診所，則於5月31日至6月8日間，共計獲配85瓶疫苗。
柯文哲說，北市衛生局之所以配發給前述6家基層診所，是依據中央疾管署的函文（疾管防字第1100200253號），公文中詳述「若合約醫院新冠疫苗庫存量過多，評估無法於期限內用畢，爲使疫苗有效運用，可在轄區衛生局人員協助下，將疫苗配送至其他合約醫院、非合約醫療診所或衛生所，需要者儘速使用」。
柯文哲強調，一開始國內疫情平穩時，疫苗施打率普遍不高，但國內疫情在5月15以來急轉直下，因此中央或地方政府防疫政策也一直滾動修正，北市府的作爲是有所本，且根據中央單位函文，也提醒中央政府相關單位不要忘記。
面對柯文哲拿出4月21日的公文作爲疫苗配分依據，林亮君10日中午表示，公文裡清楚說明必須符合以下條件，第一「合約醫院新冠疫苗庫存量過多」、第二「評估無法於效期內用畢」，然後可以在轄區衛生局人員協助下，配送至合約醫院、非合約醫療院所、衛生所。
林亮君提出4點問題，首先4月21日的衛福部公文，是由於當時疫情尚未爆發，國人施打疫苗意願較低，希望疫苗不要存在醫院裡沒人打，最後過期而浪費5月30日就要到期的疫苗，所以請地方政府協助視情況調整配發，但現在衆多醫事人員都還沒辦法獲得接種，絕對不會有過期問題。
林亮君提及，第二，中央於6月1日配發臺北市的5萬4000劑疫苗，效期是到8月31日。第三，哪幾家合約醫院的疫苗庫存量過多？所以這些配送到診所的疫苗，是由合約醫院的額度調過來的？
林亮君說，第四，如果真的需要調整配發，配送地點有3個選擇，爲什麼不選擇配到其他合約醫院？就她所知北市聯醫的疫苗都打完了，北市府可以配給已打完合約醫院，讓對方可以再度幫忙進行一到三類人員的疫苗接種，也可以配到幾個疫情比較嚴重的行政區健康中心，「但爲什麼市府選擇配發給其他的醫療院所？至今仍然沒有解答。」
最後，林亮君痛批，北市府召開了臨時記者會，短短10分鐘，柯文哲花了不到三分之一的時間，向市民說明診所的疫苗事件，卻卻留下更多疑問，也不讓媒體提問，市府是真的有心想要說明白嗎？